1.国家自然科学基金，61872218，面上项目，单细胞组学数据异质性解读的计算理论和方法，2019/01-2022/12，参与。
2.国家重点研发计划精准医学重点专项，2018YFC0910400，精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发，2018/07-2020/12，参与。
3.国家自然科学基金，61673231，面上项目，微生物组构成分析的精确方法研究，2017/01-2020/12，参与。
4.国家973计划，2012CB316500，基于新一代测序的生物信息学理论与方法，2012/01-2016/08，参与。